Автоматизированная пробоподготовка для воспроизводимой клинической протеомики

Докладчик: Йерун Кригсвельд Немецкий центр исследований рака и Гейдельбергский университет, медицинский факультет Николас Отрет, доктор философии Старший менеджер по развитию бизнеса, Covaris Игнаси Форне, доктор философии Технический руководитель лаборатории протеомики, Биомедицинский центр Университета Людвига Максимилиана в Мюнхене Вебинар: Автоматизированная подготовка образцов для воспроизводимой клинической протеомики Аннотация вебинара: Протеомные технологии на основе масс-спектрометрии (МС) все чаще применяются в клинической практике для классификации заболеваний и диагностики, однако их стандартизированное использование по-прежнему затруднено рядом проблем, связанных с обработкой образцов. Здесь я представлю, как мы интегрировали ультразвуковую обработку на основе AFA в автоматизированный протеомный рабочий процесс, чтобы обеспечить рутинный, надежный и всесторонний протеомный анализ с минимальными затратами времени на ручную работу. Это может быть применено к клеткам, свежим тканям и FFPE-тканям, охватывая таким образом весь спектр типов клинических образцов и демонстрируя универсальную полезность. Более того, одновременно можно обрабатывать 96 образцов, обеспечивая высокую производительность в стандартизированных условиях. Чувствительность подхода будет продемонстрирована на экспериментах с низким количеством образцов, начиная со 100-1000 клеток. Будут представлены данные о применении этого конвейера к когорте из 96 образцов опухолей эпендимомы, где полученные протеомные данные были интегрированы с другими омиксными слоями, что позволило проводить индивидуальное молекулярное профилирование и субклассификацию заболеваний. Преимущества адаптивной сфокусированной акустики для протеомной лаборатории Протеомика требует стратегий, способных обрабатывать сотни образцов надежным и воспроизводимым образом, независимо от происхождения интересующего материала. На этом вебинаре я покажу, как лаборатория протеомики Биомедицинского центра Мюнхенского университета использует ультразвуковую обработку на основе адаптивной сфокусированной акустики для создания универсальных рабочих процессов, которые могут быть применены к протеомным исследованиям различных образцов, включая FFPE, тромбы или небольшое количество клеток. Стандартизация, воспроизводимость и высокая пропускная способность этих рабочих процессов облегчили анализ больших когорт и предоставили нашим партнерам по сотрудничеству протеомные данные, готовые для клинической или биологической интерпретации и интеграции с другой омиксной информацией. LabRoots в социальных сетях: LinkedIn: https://www.linkedin.com/company/labroots Pinterest: https://www.pinterest.com/labroots/ SnapChat: labroots_inc