Пытаюсь исправить конструктор полимеров: какой подход лучше?

Это последнее видео из серии «Молекулярная динамика полимеров с использованием Julia». Я пробую разные способы исправить инструмент построения полимеров, запрограммированный в Julia, чтобы избежать столкновений между атомами в соседних фрагментах. К ним относится упрощенный метод Монте-Карло, попытка оптимизировать углы вращения для получения оптимальной ориентации каждого мономера относительно предыдущего. Пока это не сработало, поэтому я оптимизирую начальную конформацию мономера с помощью Chemcraft.